Das ISSK ist eine zentrale Einrichtung der Johannes Gutenberg-Universität Mainz in Form einer zentralen Betriebseinheit. Das ISSK wird von einer hauptamtlichen Mitarbeiterin oder einem hauptamtlichen Mitarbeiter der JGU geleitet. Die Leiterin oder der Leiter wird vom Senat, im Einvernehmen mit dem Präsidenten, bestellt.
Organisatorisch besteht das ISSK aus den drei Bereichen Fachunterricht, Deutsch als Fremdsprache und Fremdsprachen.
